Βασικά Στοιχεία Ενζυμολογίας: Η Κυτταρική και Μοριακή Βιολογία των Καταλυτικών Πρωτεϊνών (3η έκδοση)

 Από την κυκλοφορία της επιτυχούς και δημοφιλούς δεύτερης έκδοσης του βιβλίου Βασικά Στοιχεία Ενζυμολογίας το 1989 έχει σημειωθεί μια μεγάλη αύξηση στη γνώση διαφόρων πτυχών της Ενζυμολογίας, όχι μόνο η μεγάλη επιτάχυνση στον χαρακτηρισμό των δομών των ενζύμων και η ανάπτυξη του πεδίου της Βιοπληροφορικής. Αυτή η νέα έκδοση δίνει έμφαση στη νέα γνώση και εδραιώνει την ισχύ των προηγούμενων εκδόσεων.

Τα πινάκια βρίσκονται στο πίσω μέρος του βιβλίου

Πρόλογος 3ης έκδοσης vii

Πρόλογος 2ης έκδοσης viii

Πρόλογος 1ης έκδοσης ix

Ευχαριστίες  x

Ευχαριστίες 2ης έκδοσης  x

Ευχαριστίες 3ης έκδοσης x

Πρόλογος ελληνικής έκδοσης xi

Κεφάλαιο   1  Εισαγωγή 1

1.1 Στόχοι του βιβλίου 1

1.2 Ιστορική αναδρομή 1

1.3 Αξιοσημείωτες ιδιότητες των ενζύμων ως καταλύτες 4

1.4 Συμπαράγοντες 8

1.5 Ονοματολογία και ταξινόμηση των ενζύμων 8

1.6 Τα περιεχόμενα του βιβλίου 13

Βιβλιογραφία 14

Κεφάλαιο   2  Ο καθαρισμός των ενζύμων 16

2.1 Εισαγωγή 16

2.2 Γιατί απομονώνουμε ένζυμα; 16

2.3 Στόχοι και στρατηγική στον καθαρισμό ενζύμων 17

2.4 Επιλογή της πηγής του ενζύμου 18

2.5 Μέθοδοι ομογενοποίησης 21

2.6 Μέθοδοι διαχωρισμού 23

2.7 Πώς να κρίνουμε την επιτυχία μιας διαδικασίας καθαρισμού 36

2.8 Παραδείγματα διαδικασιών καθαρισμού ενζύμων 38

2.9 Συμπεράσματα από τα παραδείγματα καθαρισμού (απομόνωσης) ενζύμων 46

Βιβλιογραφία 47

Κεφάλαιο   3  Η δομή των ενζύμων 50

3.1 Εισαγωγή 50

3.2 Προσδιορισμός της σχετικής μοριακής μάζας, Mr51

3.3 Προσδιορισμός της αμινοξικής αλληλουχίας και πρωτοταγής δομή 57

3.4 Προσδιορισμός δευτεροταγούς και τριτοταγούς δομής 79

3.5 Προσδιορισμός της τεταρτοταγούς δομής 105

3.6 Η αναδίπλωση και η αποδιάταξη των ενζύμων 111

3.7 Τελικές παρατηρήσεις 115

Βιβλιογραφία 116

Παράρτημα 3.1 121

Βιβλιογραφία για το Παράρτημα 3.1 122

Κεφάλαιο   4  Εισαγωγή στην κινητική των ενζύμων 123

4.1 Περιγραφή του κεφαλαίου 123

4.2 Πώς λαμβάνουμε κινητικά δεδομένα;  124

4.3 Πώς αξιολογούμε κινητικά δεδομένα; 126

4.5 Τελικές παρατηρήσεις 155

Βιβλιογραφία  155

Παράρτημα 4.1 157

Παράρτημα 4.2 158

Παράρτημα 4.3 159

Βιβλιογραφία των Παραρτημάτων  160

Κεφάλαιο   5  Ο μηχανισμός της ενζυμικής δράσης 161

5.1 Εισαγωγή 161

5.2 Ορισμός του μηχανισμού μιας αντίδρασης που καταλύεται από ένζυμα 161

5.3 Θεωρητικό υπόβαθρο της κατάλυσης 162

5.4 Πειραματικές προσεγγίσεις για τον καθορισμό ενζυμικών μηχανισμών 169

5.5 Παραδείγματα ενζυμικών μηχανισμών 184

5.6 Συμπερασματικά σχόλια στους ενζυμικούς μηχανισμούς 220

Βιβλιογραφία 221

Κεφάλαιο   6  O έλεγχος της ενζυμικής δραστικότητας 225

6.1 Εισαγωγή 225

6.2 Έλεγχος των δραστικοτήτων τωνμονομερών ενζύμων 226

6.3 Έλεγχος των μεταβολικών μονοπατιών 246

6.4 Παραδείγματα ελέγχου μεταβολικών μονοπατιών 259

6.5 Τελικές παρατηρήσεις 277

Βιβλιογραφία 277

Παράρτημα 6.1 281

Κεφάλαιο   7  Ένζυμα σε οργανωμένα συστήματα 284

7.1 Εισαγωγή 284

7.2 Οργανωμένα ενζυμικά συστήματα 284

7.3 Η πολυμεράση του RNA από το E. coli  285

7.4 Η ύπαρξη και η απομόνωση των πολυενζυμικών πρωτεϊνών 293

7.5 Φυλογενετική κατανομή των πολυενζυμικών πρωτεϊνών  294

7.6 Οι ιδιότητες των πολυενζυμικών πρωτεϊνών  295

7.7 Το πολυενζυμικό σύμπλοκο της αφυδρογονάσης του πυροσταφυλικού και συναφή συστήματα  297

7.8 Το πολυενζυμικό σύμπλοκο της αποκαρβοξυλάσης της γλυκίνης  306

7.9 Το πολυενζυμικό σύμπλοκο της συνθάσης της τρυπτοφάνης του E. coli  306

7.10Η συνθάση του φωσφορικού καρβαμοϋλίου και τα παρεμφερή ένζυμα των βιοσυνθετικών μονοπατιών της πυριμιδίνης και της αργινίνης στο E. coli, στους μύκητες και στα κύτταρα των θηλαστικών    312

7.11 Πολυενζυμικά πολυπεπτίδια: η συνθάση των λιπαρών οξέων και το σύμπλοκο arom (ένζυμο AROM)  317

7.12 Ένζυμα που εμπλέκονται στη σύνθεση του DNA 327

7.13 Το σωμάτιο του γλυκογόνου 327

7.14 Συμπεράσματα  329

Βιβλιογραφία 330

Κεφάλαιο   8  Τα ένζυμα εντός του κυττάρου 333

8.1 Εισαγωγή 333

8.2 Ενδοκυτταρική διαμερισματοποίηση 334

8.3 Διαμερισματοποίηση μεταβολικών μονοπατιών 346

8.4 Ανυσματική οργάνωση ενζύμων που σχετίζονται με μεμβράνες 360

8.5 Οι συγκεντρώσεις των ενζύμων και των υποστρωμάτων in vivo 368

8.6 Συμπεράσματα 379

Βιβλιογραφία 380

Κεφάλαιο   9  Ανακύκληση των ενζύμων 383

9.1 Εισαγωγή 383

9.2 Κινητική της ανακύκλησης των ενζύμων 384

9.3 Μέθοδοι μέτρησης του ρυθμού ανακύκλησης των ενζύμων 386

9.4 Αποτελέσματα μετρήσεων του ρυθμού ανακύκλησης των ενζύμων 388

9.5 Πιθανή συσχέτιση του ρυθμού ανακύκλησης με τη δομή και λειτουργία των ενζύμων 389

9.6 Μηχανισμοί της πρωτεϊνικής αποδόμησης  390

9.7 Η σημασία της ανακύκλησης των ενζύμων 403

9.8 Άλλες διεργασίες κατά τις οποίες είναι σημαντική η ενδοκυτταρική πρωτεόλυση 408

9.9 Συμπεράσματα 410

Βιβλιογραφία 410

Παράρτημα 9.1 414

Κεφάλαιο   10  Κλινικά θέματα Ενζυμολογίας 415

10.1 Εισαγωγή 415

10.2 Προσδιορισμός της δραστικότητας ενζύμων για διαγνωστικούς σκοπούς στην κλινική πράξη 416

10.3 Κλινική ενζυμολογία νοσημάτων του ήπατος 419

10.4 Κλινική ενζυμολογία νοσημάτων της καρδιάς 422

10.5 Άλλες ενζυμικές δραστικότητες που αυξάνονται στον ορό σε παθολογικές καταστάσεις 424

10.6 Η ανίχνευση και η σημασία της ανεπάρκειας ενζύμων 427

10.7 Αναστολείς ενζύμων και σχεδιασμός φαρμάκων 431

10.8 Η χρήση των ενζύμων για τον προσδιορισμό της συγκέντρωσης μεταβολιτών με κλινική σημασία 433

10.9 Ενζυμική θεραπεία 440

10.10 Συμπεράσματα 445

Βιβλιογραφία 445

Κεφάλαιο   11  Ενζυμική Τεχνολογία 447