Βιοπληροφορική: Ένας Πρακτικός Οδηγός για την Ανάλυση των Γονιδίων και των Πρωτεïνών (3η έκδοση)

 Αυτή πλήρως αναθεωρημένη έκδοση του παγκοσμίου φήμης μπεστ-σέλερ παρέχει στους αναγνώστες έναν πρακτικό οδηγό που καλύπτει ολόκληρο το φάσμα των βασικών εννοιών στη βιοπληροφορική, από βάσεις δεδομένων έως προγνωστικούς και συγκριτικούς αλγόριθμους. Χρησιμοποιώντας σχετικά βιολογικά παραδείγματα, το βιβλίο παρέχει το υπόβαθρο και της στρατηγικές για τη χρήση πολλών από τις πιο ισχυρές και συνήθεις υπολογιστικές προσεγγίσεις που χρησιμοποιούνται για τις βιολογικές ανακαλύψεις. Η Τρίτη Έκδοση ενισχύει τις βασικές έννοιες που έχουν αντέξει στον χρόνο, ενημερώνοντας παράλληλα τον αναγνώστη για τις νέες και σημαντικές εξελίξεις σε αυτό το ταχέως εξελισσόμενο πεδίο. Με νέα πλήρως έγχρωμη εμφάνιση και πιο ευκρινή σχεδιασμό, η Βιοπληροφορική, Τρίτη Έκδοση παρέχει την πιο ευανάγνωστη, ενημερωμένη και σχολαστική εισαγωγή στο πεδίο για τους βιολόγους.

Περιεχόμενα, ix
Πρόλογος, xi
Πρόλογος ελληνικής έκδοσης, xiii
Εισαγωγή, xv
Συμμετέχοντες, xvii
ΜΕΡΟΣ ΕΝΑ
ΒΑΣΕΙΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ
1 Βάσεις δεδομένων αλληλουχιών 3
Rolf Αpweiler
2 Βάσεις δεδομένων χαρτογράφησης 27
Peter S. White και Tara C. Matise
3 Ανάκτηση πληροφοριών από βιολογικές βάσεις δεδομένων 61
Αndreas D. Baxevanis
4 Βάσεις δεδομένων Γονιδιωματικής 87
Tyra G. Wolfsberg
ΜΕΡΟΣ ΔΥΟ
ΑΝΑΛΥΣΗ ΣΕ ΕΠΙΠΕΔΟ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΩΝ
5 Μέθοδοι πρόγνωσης με χρήση αλληλουχιών DNA 123
Enrique Blanco και Roderic Guigó
6 Μέθοδοι πρόγνωσης χρησιμοποιώντας αλληλουχίες RNA 153
David Mathews και Michael Zuker
7 Πολυμορφισμοί αλληλουχιών 183
James C. Mullikin και Stephen T. Sherry
ΜΕΡΟΣ ΤΡΙΑ
ΑΝΑΛΥΣΗ ΣΕ ΕΠΙΠΕΔΟ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ
8 Μέθοδοι πρόγνωσης χρησιμοποιώντας πρωτεϊνικές αλληλουχίες 211
Yanay Ofran και Burkhard Rost
9 Πρόβλεψη δομής πρωτεϊνών και ανάλυση 237
David Wishart
10 Διαμοριακές αλληλεπιδράσεις και βιολογικά μονοπάτια 267
Gary D. Bader και Anton J. Enright
ΜΕΡΟΣ ΤΕΣΣΕΡΑ
ΣΥΝΑΓOΝΤΑΣ ΣΥΣΧΕΤΙΣΕΙΣ
11 Εκτίμηση της ομοιότητας ακολουθιών/αλληλουχιών κατά ζεύγη: BLAST
και FASTA 311
Andreas D. Baxevanis
12 Δημιουργία και ανάλυση πολλαπλών στοιχίσεων πρωτεϊνικών ακολουθιών 343
Geoffrey J. Barton
13 Συναρμολόγηση ακολουθιών και μέθοδοι τελειοποίησης  359
Nancy F. Hansen, Pamela Jacques Thomas και
Gerard G. Bouffard
14 Φυλογενετική ανάλυση 385
Fiona S. L. Brinkman
15 Υπολογιστικές προσεγγίσεις στη συγκριτική γονιδιωματική 415
Andreas D. Baxevanis
16 Χρήση μικροσυστοιχιών DNA για τη μελέτη
της γονιδιακής έκφρασης 433
John Quackenbush
17 Πρωτεωμική και ταυτοποίηση πρωτεϊνών 471
Mark R. Holmes, Kevin R. Ramkissoon και Morgan C. Giddings
ΜΕΡΟΣ ΠΕΝΤΕ
ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΕΡΓΑΛΕΙΩΝ
18 Χρήση της γλώσσας προγραμματισμού Perl
σε εφαρμογές βιοπληροφορικής 503
Lincoln D. Stein
Παραρτήματα, 529
Γλωσσάρι, 549
Ευρετήριο, 557